Тема 2013 года — вода и биоразнообразие.  Вода и биоразнообразие — такая тема Дня была выбрана в 2013 году, который был назван Международным годом водного сотрудничества. Тема Дня отражает огромную роль биоразнообразия и экосистем в обеспечении водной безопасности и, тем самым, достижении целей устойчивого развития.  В 2000 году Генеральная Ассамблея постановила ежегодно отмечать Международный день биологического разнообразия 22 мая, в день принятия в 1992 году согласованного текста Конвенции о биологическом разнообразии.

«Биоразнообразие и обеспечиваемые им экосистемные услуги являются главными условиями претворения в жизнь видения мира, безопасного с точки зрения обеспеченности водой. […] Если раньше главное внимание уделялось поиску компромиссов между использованием воды и биоразнообразием, то сегодня мы начинаем осознавать взаимоусиливающуюся связь между биоразнообразием и безопасной водообеспеченностью». Из послания Генерального секретаря ООН Пан Ги Муна по случаю Дня 2013 года